中国水稻基因数据库是国家水稻数据中心下的一个数据子库。该数据库以中国水稻研究所自主设计的ontology系统进行归类，主要收录国内外文献公布的已鉴定的水稻基因数据，包括基因名称、符号、染色体位置、基因过表达或抑制表达产生的表型特征和基因功能等等。此外，对于克隆的基因，还包括它在各个主要数据库的登录号，根据该登录号，可以直接链接到相关网站查询更详细信息。
